Der hinterhältige König Olly hat Prinzessin Peach in Origami verwandelt, ihr Schloss ausgerissen und mit magischen Luftschlangen gefesselt. Doch keine Sorge - Mario und seine neue Gefährtin Olivia sind zur Stelle!
Auf seiner Reise, die Papierbänder zu entfernen, besucht der Spieler die unterschiedlichsten Orte, darunter brütend heiße Wüsten und weite Meere. Dabei begegnet er eine bunte Riege an Charakteren, die mit ihm zusammen die Luftschlangen lösen und verhindern, dass seine Freunde in Faltschergen verwandelt werden.
